Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pbdc1Q9D0B6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms