Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa9Q9CZN4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shisa9Q9CZN4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms