Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nde1Q9CZA6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nde1Q9CZA6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms