Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp2Q9CYZ8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp2Q9CYZ8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms