Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtpbp8Q9CY28 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtpbp8Q9CY28 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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