Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem50aQ9CXL1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem50aQ9CXL1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms