Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sgo1Q9CXH7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Sgo1Q9CXH7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Sgo1Q9CXH7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Sgo1Q9CXH7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Sgo1Q9CXH7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sgo1Q9CXH7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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