Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BccipQ9CWI3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms