Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smc1aQ9CU62 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smc1aQ9CU62 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms