Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fcf1Q9CTH6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fcf1Q9CTH6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fcf1Q9CTH6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fcf1Q9CTH6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fcf1Q9CTH6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fcf1Q9CTH6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fcf1Q9CTH6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fcf1Q9CTH6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fcf1Q9CTH6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fcf1Q9CTH6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fcf1Q9CTH6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fcf1Q9CTH6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fcf1Q9CTH6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fcf1Q9CTH6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fcf1Q9CTH6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fcf1Q9CTH6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fcf1Q9CTH6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fcf1Q9CTH6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fcf1Q9CTH6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fcf1Q9CTH6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fcf1Q9CTH6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fcf1Q9CTH6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fcf1Q9CTH6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fcf1Q9CTH6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fcf1Q9CTH6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fcf1Q9CTH6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fcf1Q9CTH6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fcf1Q9CTH6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fcf1Q9CTH6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fcf1Q9CTH6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fcf1Q9CTH6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fcf1Q9CTH6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fcf1Q9CTH6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fcf1Q9CTH6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fcf1Q9CTH6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fcf1Q9CTH6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fcf1Q9CTH6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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