Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atp5sQ9CRA7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp5sQ9CRA7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms