Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ska2Q9CR46 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ska2Q9CR46 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms