Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc43Q9CR29 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc43Q9CR29 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms