Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ6

Ndufb3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb3Q9CQZ6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb3Q9CQZ6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb3Q9CQZ6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb3Q9CQZ6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb3Q9CQZ6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb3Q9CQZ6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb3Q9CQZ6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb3Q9CQZ6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb3Q9CQZ6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb3Q9CQZ6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb3Q9CQZ6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb3Q9CQZ6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb3Q9CQZ6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb3Q9CQZ6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb3Q9CQZ6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb3Q9CQZ6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb3Q9CQZ6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb3Q9CQZ6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb3Q9CQZ6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb3Q9CQZ6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb3Q9CQZ6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb3Q9CQZ6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb3Q9CQZ6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb3Q9CQZ6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ndufb3Q9CQZ6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufb3Q9CQZ6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndufb3Q9CQZ6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndufb3Q9CQZ6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndufb3Q9CQZ6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufb3Q9CQZ6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufb3Q9CQZ6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufb3Q9CQZ6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufb3Q9CQZ6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufb3Q9CQZ6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufb3Q9CQZ6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufb3Q9CQZ6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufb3Q9CQZ6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufb3Q9CQZ6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufb3Q9CQZ6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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