Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms