Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ubl4bQ9CQ84 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ubl4bQ9CQ84 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms