Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc198Q9CPZ1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc198Q9CPZ1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms