Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg3Q9CPX6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atg3Q9CPX6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms