Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPP0

Npm3, Nucleoplasmin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm3Q9CPP0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Npm3Q9CPP0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npm3Q9CPP0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms