Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlhe41Q99PV5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe41Q99PV5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms