Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bap1Q99PU7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bap1Q99PU7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bap1Q99PU7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Bap1Q99PU7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bap1Q99PU7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bap1Q99PU7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bap1Q99PU7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bap1Q99PU7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bap1Q99PU7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bap1Q99PU7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bap1Q99PU7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bap1Q99PU7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bap1Q99PU7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bap1Q99PU7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bap1Q99PU7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bap1Q99PU7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms