Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU5

Acsbg1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, mousemouse

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsbg1Q99PU5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Acsbg1Q99PU5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Acsbg1Q99PU5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Acsbg1Q99PU5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Acsbg1Q99PU5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Acsbg1Q99PU5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Acsbg1Q99PU5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Acsbg1Q99PU5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Acsbg1Q99PU5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Acsbg1Q99PU5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Acsbg1Q99PU5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Acsbg1Q99PU5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Acsbg1Q99PU5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Acsbg1Q99PU5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Acsbg1Q99PU5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Acsbg1Q99PU5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Acsbg1Q99PU5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Acsbg1Q99PU5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Acsbg1Q99PU5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Acsbg1Q99PU5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms