Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Trim26Q99PN3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trim26Q99PN3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim26Q99PN3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms