Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cep41Q99NF3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cep41Q99NF3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms