Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE9

Pbx4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx4Q99NE9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pbx4Q99NE9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pbx4Q99NE9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pbx4Q99NE9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pbx4Q99NE9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pbx4Q99NE9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pbx4Q99NE9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pbx4Q99NE9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms