Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl3Q99N95 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl3Q99N95 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms