Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac9Q99N13 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac9Q99N13 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hdac9Q99N13 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac9Q99N13 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms