Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SrrtQ99MR6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms