Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc12a9Q99MR3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc12a9Q99MR3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc12a9Q99MR3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms