Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PccbQ99MN9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PccbQ99MN9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PccbQ99MN9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PccbQ99MN9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PccbQ99MN9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PccbQ99MN9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PccbQ99MN9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PccbQ99MN9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PccbQ99MN9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms