Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkd1Q99MH6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nkd1Q99MH6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms