Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PtprtQ99M80 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PtprtQ99M80 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
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