Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nmd3Q99L48 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nmd3Q99L48 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms