Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmp1Q99KU0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmp1Q99KU0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmp1Q99KU0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms