Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ciao1Q99KN2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ciao1Q99KN2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ciao1Q99KN2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms