Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps4Q99KG7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps4Q99KG7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps4Q99KG7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms