Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1bQ99JY6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1bQ99JY6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1bQ99JY6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1bQ99JY6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1bQ99JY6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1bQ99JY6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd1bQ99JY6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Higd1bQ99JY6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Higd1bQ99JY6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Higd1bQ99JY6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Higd1bQ99JY6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms