Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Apobec3Q99J72 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apobec3Q99J72 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms