Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Cldn16Q925N4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Cldn16Q925N4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Cldn16Q925N4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Cldn16Q925N4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Cldn16Q925N4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn16Q925N4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Cldn16Q925N4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Cldn16Q925N4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Cldn16Q925N4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Cldn16Q925N4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Cldn16Q925N4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Cldn16Q925N4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Cldn16Q925N4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Cldn16Q925N4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Cldn16Q925N4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn16Q925N4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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