Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PdgfdQ925I7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdgfdQ925I7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms