Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b5Q923D4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b5Q923D4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b5Q923D4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b5Q923D4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b5Q923D4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b5Q923D4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b5Q923D4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b5Q923D4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b5Q923D4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b5Q923D4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b5Q923D4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b5Q923D4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b5Q923D4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b5Q923D4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b5Q923D4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b5Q923D4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b5Q923D4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b5Q923D4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sf3b5Q923D4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Sf3b5Q923D4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sf3b5Q923D4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sf3b5Q923D4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b5Q923D4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms