Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim59Q922Y2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim59Q922Y2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim59Q922Y2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms