Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med28Q920D3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms