Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slc5a4bQ91ZP4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc5a4bQ91ZP4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
Slc5a4bQ91ZP4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms