Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prpf6Q91YR7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf6Q91YR7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 406.6 ms