Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb12Q91Y07 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb12Q91Y07 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms