Protein–RNA interactions for Protein: Q91WJ8

Fubp1, Far upstream element-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp1Q91WJ8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fubp1Q91WJ8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fubp1Q91WJ8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fubp1Q91WJ8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fubp1Q91WJ8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fubp1Q91WJ8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fubp1Q91WJ8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fubp1Q91WJ8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fubp1Q91WJ8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 577.7 ms