Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp3Q91W36 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp3Q91W36 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp3Q91W36 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms