Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tdrd3Q91W18 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tdrd3Q91W18 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms