Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHT7

Gtf3a, Transcription factor IIIA, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3aQ8VHT7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Gtf3aQ8VHT7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf3aQ8VHT7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 290.8 ms